Václav Luks ha iniziato i suoi studi al Conservatorio di Pilsen e all'Academy of Performing Arts di Praga (studiando corno e clavicembalo). Ha poi proseguito i suoi studi con ricerche specialistiche sulla musica antica presso la Schola Cantorum Basiliensis di Basilea.

Nel 2005, ha trasformato il Collegium 1704 da un ensemble di musica da camera in un'orchestra barocca, e ha fondato il Collegium Vocale 1704 che si è rapidamente affermato come gruppo dedicato all'esecuzione della musica dei secoli XVII e XVIII; con i suoi progetti internazionali, Luks ha giocato un ruolo importante nella rinascita della musica dei compositori boemi Jan Dismas Zelenka e Josef Myslivecek. Nel 2008, ha fondato la fortunata serie di concerti Music Bridge Prague - Dresden.

I recenti impegni di Václav Luks, con i suoi ensemble, lo hanno portato al Salzburger Festspiele, Berliner Philharmonie, Theater an der Wien, Konzerthaus Wien, Concertgebouw Amsterdam, Wigmore Hall, Versailles, Lucerner Festival, Chopin Festival e prestigiose residenze al Utrecht Early Music Festival e Bachfest Leipzig.